Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms