Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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