Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps13P62301 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms