Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fgd1P52734 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms