Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TspoP50637 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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TspoP50637 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
TspoP50637 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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