Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Epb42P49222 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms