Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab20P35295 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab20P35295 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms