Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptk2P34152 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptk2P34152 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptk2P34152 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptk2P34152 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptk2P34152 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptk2P34152 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptk2P34152 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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