Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxa10P31310 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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