Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprmP28828 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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