Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NapbP28663 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NapbP28663 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NapbP28663 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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