Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd8P23463 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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