Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms