Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TP20293 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TP20293 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TP20293 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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