Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps6ka1P18653 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms