Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18530 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18530 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18530 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms