Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P18524 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18524 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18524 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms