Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms