Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms