Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb1P12658 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms