Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm2035J3QP87 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm2035J3QP87 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm2035J3QP87 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm2035J3QP87 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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