Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vmn1r34G3XA52 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189 ms