Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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