Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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