Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf169E9Q7F2 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf169E9Q7F2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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