Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms