Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cspp1B2RX88 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms