Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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