Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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