Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms