Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkraQ9WTX2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms