Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Trappc2lQ9JME7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms