Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pole3Q9JKP7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pole3Q9JKP7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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