Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms