Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp29Q9ES63 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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