Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rnf6Q9DBU5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms