Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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