Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms