Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Nop56Q9D6Z1 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Nop56Q9D6Z1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Nop56Q9D6Z1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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