Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Phf6Q9D4J7 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Phf6Q9D4J7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Phf6Q9D4J7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms