Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms