Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms