Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cops7aQ9CZ04 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops7aQ9CZ04 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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