Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ddx28Q9CWT6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ddx28Q9CWT6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms