Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms