Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rpa3Q9CQ71 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpa3Q9CQ71 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rpa3Q9CQ71 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rpa3Q9CQ71 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rpa3Q9CQ71 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rpa3Q9CQ71 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rpa3Q9CQ71 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpa3Q9CQ71 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms