Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sike1Q9CPR7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms