Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup155Q99P88 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms