Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hdac9Q99N13 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hdac9Q99N13 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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