Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms